Iedere geografische zone van Peru heeft zijn eigen klimaat. De zomer in het kustgebied (dec-apr) is warm en droog met temperaturen van 25 tot 30 graden celcius. Dit is de beste tijd om naar het strand te gaan. Tijdens de winter (mei-nov) is de temperatuur een beetje koeler en is het bewolkt.

In het berggebied is het van april tot oktober heet en droog overdag (heet in de zon!) en koud en droog ´s nachts (vaak daalt de temperatuur tot net onder het vriespunt).

Tijdens het droge seizoen in de jungle (apr-oct) kunnen de temperaturen oplopen tot 35 graden Celcius. Dit is de beste periode om de jungle te verkennen, want van november tot april is het regenseizoen en hoewel het maar een paar uur achter elkaar regent in deze periode (niet zoveel dat het je reis zal bederven), is het genoeg om veel wegen nagenoeg onbegaanbaar te maken.

Peru´s hoogseizoen is van juni tot september, wat de beste tijd is om de Incatrail te bewandelen of om een trekking, of klimtocht te maken door andere delen van het land.